Métodos de Diagnóstico, Técnicas e Aplicações II

Métodos de Ensino

Será efetuada uma palestra teórica sobre estes campos da biologia molecular. Para as competências práticas será realizado um workshop e os alunos terão oportunidade de participar em visitas de estudo.
A avaliação da componente teórica é uma avaliação escrita (70%) (tem de obter 60% para passar). A componente prática será avaliada através de um relatório de atividade laboratorial escrito com a documentação da preparação das amostras, execução dos programas e análise de dados (30%).

Resultados de Aprendizagem

Conhecimento avançado  e especialização no campo dos métodos moleculares como PCR em Tempo Real e Next Generation Sequencing. Conhecimento de vantagens, limitações e aplicações de diferentes abordagens (NGS e Real Time PCR). Saber os princípios, métodos e técnicas relacionados com a NGS e PCR em Tempo Real.
Ser capaz de compreender e comunicar os princípios e métodos mais importantes. O aluno é capaz de trabalhar como parte de uma equipa, capaz de desenvolver ensaios  nestas áreas de biologia molecular
avançadas.  Capacidade  de executar  protocolos de RT-PCR e NGS.
Colaborar com a equipa de bioinformática de TI para gerir e controlar fluxos de trabalho, amostras e resultados. Usar uma variedade  de ferramentas de bioinformática para realizar uma análise básica de dados NGS e RTPCR. Submeter,  navegar e aceder a uma série de dados NGS em repositórios públicos.
Discutir uma variedade  de aplicações e abordagens de fluxo  de trabalho

Programa

Plataformas NGS, arquivos de dados e formatos, Bioestatística, Bioinformática, passos  do fluxo  de trabalho, NGS experimental e planeamento de RT-PCR, controlo da qualidade, interpretação de dados e resultados, resolução de problemas, Perspetivas para o futuro.

Estágio(s)

NAO

Bibliografia

Nick Saunders.  Martin Lee. Real Time PCR: Advanced Technologies and Applications. Health Protection Agency,  Colindale, UK and Porton  Consulting Research Ltd. Salisbury, UK. July 2013
Jianping Xu. Next-Generation Sequencing: Current  Technologies and Applications. McMaster University, Ontario,  Canada. March 2014