Modelação Avançada em Biomedicina

Conhecimentos de Base Recomendados

Cálculo I, Cálculo II, Análise Numérica e Programação

Métodos de Ensino

A unidade curricular adota uma abordagem pedagógica que combina teoria, prática e aplicação em problemas reais. As metodologias incluem:
– Aulas teóricas: Apresentação de conceitos fundamentais de modelação matemática, métodos numéricos e aplicações biomédicas. Estas aulas são expositivas e interativas, promovendo a participação ativa dos estudantes.
– Aulas práticas: Implementação de modelos matemáticos e métodos numéricos utilizando software especializado (MATLAB ou Python). Estas aulas são realizadas em laboratório, com exercícios práticos que permitem aos estudantes aplicar os conceitos teóricos.
– Trabalhos de grupo: Desenvolvimento de projetos que envolvem a resolução de problemas reais em biomedicina, como a modelação de difusão de fármacos, propagação de calor em tecidos e modelação de tumores.
– Acompanhamento contínuo: Os estudantes recebem feedback regular sobre o seu desempenho, com sessões de tutoria em aulas dedicadas para esclarecer dúvidas e orientar os projetos.

Estas metodologias promovem a aprendizagem ativa, o desenvolvimento de competências práticas e a capacidade de resolver problemas complexos, em linha com os objetivos de aprendizagem.

Resultados de Aprendizagem

A unidade curricular visa capacitar os estudantes a aplicar técnicas avançadas de modelação matemática e computacional para resolver problemas biomédicos complexos. Os estudantes irão:
– Desenvolver competências em modelação baseada em Equações de Derivadas Parciais (EDPs), redes e agentes.
– Implementar métodos numéricos (diferenças finitas e elementos finitos) para resolver problemas biomédicos, como difusão de fármacos, propagação de calor e fluxo sanguíneo.
– Utilizar software especializado para simulação e análise de sistemas biomédicos.
– Validar modelos com dados experimentais e interpretar os resultados.
– Desenvolver competências de investigação e comunicação científica.
– O método de ensino combina aulas teóricas para introdução de conceitos, aulas práticas para aplicação de métodos e desenvolvimento de projetos para consolidar competências.

Programa

Modelos matemáticos envolvendo EDPs estudados com recurso a técnicas de Análise Numérica:
– Libertação de fármaco a partir de um implante polimérico
– Propagação de calor em tecidos durante tratamentos térmicos
– Simulação de fluxo sanguíneo em artérias
– Modelação de Tumores e Terapias
– Simulação de Processos de Cicatrização de Feridas
– Modelação de Infeções e Resposta Imunológica

Conteúdos de modelação e de análise numérica:
– Papel dos modelos em engenharia biomédica
– Estudo de Equações de Derivadas Parciais
– Leis de Fick e estudo a equação da difusão
– Métodos Numéricos: Diferenças Finitas e Elementos Finitos
– Utilização de software para implementação dos métodos estudados
– Casos de estudo com resolução de Modelos aplicados à Engenharia Biomédica

Docente(s) responsável(eis)

Pascoal Martins da Silva

Métodos de Avaliação

Classificação Final = (1) + (2) + (3)

(1) Componente escrita: peso de 6 valores em 20, mínimos de 2 valores em 6, a realizar numa das épocas regulamentares.

(2) Dois trabalhos: cada trabalho tem um peso de 6 valores em 20, sem mínimos; os trabalhos são realizados em grupos de 2 alunos, sendo a classificação atribuída individualmente. A avaliação dos trabalhos envolve a realização de uma defesa. A não comparência na defesa acarreta uma avaliação nula no trabalho correspondente.

(3) Atividades realizadas em contexto de aula: peso de 2 valores em 20, sem mínimos.

A aulas PL têm um número mínimo de 10 presenças. O incumprimento deste limite mínimo implica uma penalização de 2 valores na nota de cada trabalho.

Os alunos com estatuto de trabalhador-estudante seguem as mesmas regras de avaliação, podendo acordar com o docente a realização de um exame cotado para 20 valores a realizar nas épocas regulamentares em alternativa às componentes de avaliação (1), (2) e (3).

A realização de provas orais complementares poderá constituir um instrumento de avaliação adicional, sempre que se considere necessária para dissipar dúvidas ou esclarecer situações suspeitas de fraude ou plágio.


    Estágio(s)

    NAO

    Bibliografia

    Evans, L. C. (2010). Partial differential equations (2nd ed.). American Mathematical Society.
    Logan, D. L. (2012). A first course in the finite element method (5th ed.). Cengage Learning.
    Saltzman, W. M. (2001). Drug delivery: Engineering principles for drug therapy. Oxford University Press.
    Formaggia, L., Quarteroni, A., Veneziani, A. (2009). Cardiovascular mathematics: Modeling and simulation of the circulatory system. Springer.
    Murray, J. D. (2002). Mathematical biology I: An introduction (3rd ed.). Springer.
    MathWorks. (n.d.). MATLAB Partial Differential Equation Toolbox: User’s Guide.
    Reddy, J. N., Anand, N. K., Roy, P. (2022). Finite element and finite volume methods for heat transfer and fluid dynamics. Cambridge University Press.
    Vandandoo, U., Zhanlav, T., Ochbadrakh, O., Gusev, A., Vinitsky, S., Chuluunbaatar, G. (2024). High-order finite difference and finite element methods for solving some partial differential equations. Springer Cham.