Bioinformática

 Pressupõe-se formação prévia em Biologia Molecular e Genética.

Para a concretização dos objectivos da unidade curricular e a conferência das competências previstas aos estudantes, o processo de ensino aprendizagem assenta:
Na exposição pelo docente de conteúdos relacionados com os aspectos teóricos desta unidade curricular, por vezes apoiadas em workshops dados com computador operados pelos alunos;

Na pesquisa bibliográfica orientada sobre alguns temas de interesse;
Na execução e discussão de trabalhos práticos laboratoriais de computação operados pelos alunos em computador.

Introdução à utilização de recursos computacionais já disponíveis em Bioinformática (na óptica do utilizador) para obtenção de respostas a questões da Biologia Molecular, Genética e Engenharia Genética.

Aprendizagem sobre os fundamentos e as principais técnicas usadas em Bioinformática. (Nota: a aquisição de competências sobre o funcionamento dos programas será a estritamente necessária à compreensão de parâmetros que o utilizador deve definir para a obtenção de resultados).

Organismos de referência; sequenciação de genomas e anotação.
Bancos de dados de sequências nucleotídicas e aminoácidicas, em projectos Genoma, Transcriptoma e Proteoma, para obter, armazenar, organizar, arquivar, analisar, ou visualizar dados.
Uso de ferramentas computacionais, nomeadamente para análise de sequências de DNA e de proteínas, alinhamento de sequências (simples e múltiplos); pesquisa de motivos, análise estrutural, construção de árvores filogenéticas, caracterização de repetições em genomas.

• - Exame Prático - 50.0%
• - Exame Teórico - 50.0%

NAO

Claverie, JM e Notredame, C (2011). Bioinformatics for dummies. 2ª Ed., Wiley. ISBN: 9781118051108.
Higgs, PG e Attwood, TK (2005). Bioinformatics and molecular evolution. Blackwell, Malden, MA, USA.
Korf, I; Yandell, M; Bedell, J (2003). BLAST. 1ª Ed., O’Reilly Media. ISBN10: 0596002998.
Lesk, AM (2005). Introduction to bioinformatics. 2ª Ed., Oxford University Press. ISBN: 0199277877.
Mount, DW (2004). Bioinformatics: Sequence and genome analysis. 2ª Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press. ISBN: 0879697121.
Recursos WEB com aplicações bioinformáticas.